Autismeforeningen opsagde den 21. oktober 2023 samarbejdsaftalen med Autisme- og Aspergerforeningen, en beslutning, som Autisme- og Aspergerforeningens bestyrelse finder uforståelig. Foreningen har i mange år afholdt egne konferencer, uafhængigt af Autismeforeningen. Nina Catalina Michaelsen, landsformand for Autisme- og Aspergerforeningen, står også overfor mulig eksklusion fra Autismeforeningen. Denne beslutning og den ensidige opsigelse af samarbejdsaftalen blev truffet uden forudgående dialog, hvilket har chokeret Autisme- og Aspergerforeningens bestyrelse.